Overview

Bu eğitim, tek hücre RNA dizileme (scRNA-seq) analizi alanında derinlemesine bilgi edinmek isteyen araştırmacılar, öğrenciler ve yaşam bilimlerinde kariyer hedefleyenler için özel olarak tasarlanmıştır. Hücre düzeyindeki gen ekspresyon farklılıklarını anlamak, hücresel heterojenliği çözümlemek ve biyolojik süreçleri daha ayrıntılı analiz etmek için scRNA-seq, günümüz biyoinformatiğinin en güçlü araçlarından biridir. Eğitim süresince, Seurat paketi kullanılarak örnek verilerle yapılan uygulamalar sayesinde gerçek dünya verisi üzerinde analiz yapma becerisi kazanacaksınız.Kurs, boyut indirgeme tekniklerinden (PCA, t-SNE, UMAP) kümeleme algoritmalarına, diferansiyel gen ekspresyon analizinden gen düzenleyici ağların tahminine kadar geniş bir analiz yelpazesini kapsamaktadır. Bu süreçte, hücre çiftlenmelerini tespit etmek için DoubletFinder aracı kullanılarak verinin kalitesi artırılırken, hücre tiplerinin otomatik olarak tanımlanması için SingleR paketiyle referans veri kümelerine dayalı sınıflandırmalar gerçekleştirilir. R programlama dili temelinde ilerleyen bu içerik, katılımcıların teorik bilgiyi güçlü bir pratik altyapı ile birleştirmelerini sağlar. Ayrıca Seurat paketiyle gerçekleştirilen görselleştirme ve biyolojik yorumlama teknikleri, elde edilen sonuçların anlamlandırılmasında kritik rol oynar. Katılımcılar, gerçek veriler üzerinden hem hücresel heterojenliği analiz etmeyi hem de elde edilen bulguları bilimsel bir bağlamda değerlendirmeyi öğrenir.Bu kapsamlı eğitimle, hem tek hücre RNA dizileme (scRNA-seq) analiz tekniklerini derinlemesine öğrenerek analiz yetkinliğinizi artırabilir, hem de biyolojik verileri hücre düzeyinde değerlendirerek araştırmalarınızda önemli farklar yaratabilirsiniz. Eğitim boyunca edindiğiniz becerilerle, biyolojik sistemlerin daha ayrıntılı bir haritasını çıkarabilecek, hücresel heterojenlikleri keşfederek gen ekspresyonu üzerindeki ince ayrıntıları ortaya koyabileceksiniz. Ayrıca, Seurat paketi ve diğer araçlarla gerçekleştireceğiniz uygulamalar sayesinde, verilerinizi anlamlandırma ve biyolojik anlamlarını doğru şekilde çıkarma konularında sağlam bir altyapı kazanacaksınız.

Skills

Reviews